Базы данных последовательностей

Базы данных последовательностей * базы даных паслядоўнасцей * sequences data bases — в зависимости от профиля Б. д. п. содержат структурированную информацию о белковых, нуклеотидных либо сигнальных последовательностях, представленную в виде записей. Ниже приводится список наиболее популярных баз данных. 1. GenBank (http://www/ncbi/nlm/nih.gov), поддерживаемый Национальным центром по информации в области биотехнологии, США (National Center of Biotechnology Information, NCBI, USA). Банк содержит сотни тысяч нуклеотидных последовательностей. Поиск ведется по последовательности или по ключевым словам. 2. EMBL (http://embl- heidelberg.de) — база данных нуклеотидных последовательностей, которая поддерживается Европейской лабораторией молекулярной биологии, Германия (European Molecular Biology Laboratory, Germany). Система организации записей практически идентична системе GenBank. 3. Идентификация белков (PIR or Protein Indentification Resource) — база данных белковых последовательностей, которая поддерживается тремя организациями: The National Biochemical Research Foundation, USA; The Martinsried Institute for Protein Sequences, Europe; The Japan International Protein Information Dat abase, Japa n (ht t p://gdb.org). 4. Ба за данных белков (PDB or Protein Databank) (http://www.pdb.bni.gov). В каждой записи представлена общая информация о белке, а также список атомов в структуре с указанием трехмерных координат и визуальным представлением пространственной структуры молекул. Поддерживается в Брукхэвене, США (Brookhaven, USA). Список других баз данных доступен на веб-сайте http://srs.ebi/ac/uk/srs5bin/cgi-bin/wgetz.